有机肥生产设备虽然常用，但是关于它的工产工艺大多数人并不是有很多了解，比如在处理堆肥方面。既然有机肥生产设备是一个专业性很强的产品，因此工艺过程也都是非常严格的。

有机肥生产设备处理堆肥的首要步骤是前处理，就是将要处理的垃圾、粪便、污泥等按要求调整水分和碳氮比，必要时添加菌种和酶。这也是为了一次发酵做准备，有机肥生产设备进行发酵时首先是分解易分解的有机物糖类等降解，微生物将细胞中吸收的营养物质分解，同时产生热量使堆肥温度上升。

完成之后，有机肥生产设备将开始二次发酵，主要是对在一次发酵中难降解的有机物进行全部降解，使其变为腐殖质、氨基酸等较稳定的有机物，得到完全成熟的堆肥产品。

还需要利用有机肥生产设备对堆肥产品进行后处理，以为在前处理中尚未完全除去的玻璃、金属、塑料、小石块等，还要通过这道工序分选取出。有些堆肥工艺结束后会有臭味，因此有机肥生产设备还要予以脱臭处理。

由于堆肥一般在春秋两季使用，暂时不能用上的堆肥要妥善贮存，常规的方式是将其装入袋中，干燥、通风保存。一般来说还是建议把有机肥做成颗粒肥出售，提高其价值。